Prime Target, dâhi matematik öğrencisi olan bir karakterin, büyük bir buluş yapmak üzereyken karşısına çıkan şüpheli bir düşmanla mücadelesini konu alıyor. Ana karakter, buluşunu yapmak için hırslı bir şekilde çalışırken, hayatıyla ilgili bir tehlike olduğunu fark eder. Bu tehlikeyle mücadele etmek ve hayatta kalmak için bir hükûmet ajanıyla iş birliği yaparak çok riskli bir komployu çözmeye çalışır. Matematik dehası ve hükûmet ajanının bir araya gelmesiyle izleyiciler, gerilim dolu bir maceraya tanıklık eder.