Naruto, Kyubii adlı efsanevi tilki tarafından içine hapsedildiği için halk tarafından dışlanan ve yaratık olarak görülen bir gençtir. Ancak Naruto'nun asıl hayali, Ninja akademisini başarıyla tamamlayıp Hokage unvanına sahip olmaktır. Bu hedefi doğrultusunda mücadele eden Naruto, akademiye katıldığında kendisini birçok maceranın içinde bulur ve içinde sakladığı Kyubii'nin gücünü keşfetmeye başlar.

Naruto'nun yaşadığı bu serüvenler, hem yeteneklerini geliştirmesine hem de kendini kabul ettirmesine yardımcı olur. Ancak onu zorlu sınavlar, güçlü düşmanlar ve kendi içindeki karanlıkla da mücadele etmek beklemektedir. Naruto'nun hikayesi, dostluk, cesaret ve kendini aşma temalarıyla dolu bir dizi olarak karşımıza çıkar.