Common Side Effects, eski lise laboratuvar ortakları Marshall ve Frances'in hikayesini konu alıyor. Marshall ve Frances, tüm dünya hastalıklarını iyileştirmenin anahtarını tutabilecek nadir bir mantarın bilgisini bastırmak için Big Pharma ve federal hükümeti içeren bir komployu çözmeye başlar. Başlarına gelen olaylar, onları bilim dünyasının karanlık yönüyle yüzleşmeye zorlar ve riskli bir arayışın içine sürükler.